博物馆分为各种不同的展区，有蒙古区，哈萨克区，塔吉克区以及文物展示区。陈列着各类图片、文字说明、少数民族服饰、工具、工艺装饰品等实物。展品的布置与陈列极富想象力，特别值得一提的是新疆古墓中发现的古代人的木乃伊，如著名的“楼兰美女”的木乃伊。
